Invitrogen™ Collibri™ Stranded RNA Library Prep Kit for Illumina™ Systems

Les kits de préparation de bibliothèques d’ARN multibrin Invitrogen Collibri sont conçus pour le séquençage de nouvelle génération (NGS) sur les systèmes Illumina. Le kit prend en charge les applications de séquençage de transcriptome entier (humain, souris, rat) et de l’ARNm (compatible avec toutes les espèces).

Le kit de préparation de bibliothèques d’ARN multibrin Collibri :
• Comprend tous les composants nécessaires dans un kit unique* pour une utilisation rapide
• ARN total converti en bibliothèque prête au séquençage en moins de 4,5 heures
• > 98 % de spécificité de brins, détection efficace de l’ARN non codant et haute sensibilité de l’expression génétique différentielle
• Fournit un retour visuel en cours pour un traitement plus facile
• Convient à l’automatisation conventionnelle pour augmenter le débit

Le kit de préparation de bibliothèques d’ARN multibrin Invitrogen Collibri pour les systèmes Illumina est conçu pour la construction robuste de bibliothèques d’ADNc pour le séquençage d’ARN spécifique aux brins sur les systèmes de séquençage de nouvelle génération (NGS) Illumina. Le kit regroupe les caractéristiques supérieures de la transcriptase inverse SuperScript IV, des particules magnétiques Dynabeads et de l’ADN polymérase Platinum SuperFi, permettant ainsi aux utilisateurs d’obtenir des bibliothèques prêtes à l’emploi pour le séquençage de haute qualité. Ce kit de préparation de bibliothèques d’ARN multibrin Collibri prend en charge la préparation rapide de bibliothèques en moins de 4,5 heures pour les bibliothèques d’ARNm ou de transcriptome entier avec 1 à 25 ng d’entrée d’échantillons d’ARN enrichi en ARNm ou appauvri en ribo. Le multiplexage de bibliothèques peut être effectué à l’aide de 96 amorces à double indexation unique ou à indexation unique, permettant ainsi un séquençage à lecture unique ou à extrémité appariée. Le kit convient aux échantillons d’ARN de qualité différente, y compris les échantillons FFPE.

Signaux visuels d’intégrité du processus
Pour un maximum de commodité, des signaux visuels de l’intégrité des processus sont inclus dans tout le flux de travaux de préparation pour les bibliothèques. Surveillez l’évolution de la génération de bibliothèques à l’aide des retours visuels des colorants dans les réactifs critiques. Le Reaction Mix change de couleur en réponse à l’ajout de composants critiques à chaque étape afin de s’assurer que la préparation de bibliothèques optimise ses chances de réussite. Les colorants inertes n’interfèrent pas avec les réactions enzymatiques et ne compromettent pas les résultats de séquençage.

Fonctionnement
Les adaptateurs compatibles avec Illumina pleine longueur sont introduits par amplification par PCR à l’aide de l’ADN polymérase Platinum SuperFi pour construire des bibliothèques à double indexation unique ou à indexation unique compatibles avec le séquençage à lecture unique ou à extrémité appariée. Le kit contient 24 ou 96 amorces pour PCR à code-barres (i7) indexées individuellement et pré-mélangées avec un amorceur i5 universel ou des amorces pour PCR à double indexation uniques qui permettent le multiplexage de 96 bibliothèques maximum. Les étapes de purification optimisées éliminent efficacement les amorces résiduelles et les dimères d’adaptateur / d’amorce tout en préservant les rendements élevés des bibliothèques.

Un produit associé, le kit de quantification de bibliothèques Collibri, est recommandé pour quantifier les bibliothèques basées sur la qPCR avant de procéder au séquençage.

Applications
Le kit de préparation de bibliothèques d’ARN multibrin Collibri est recommandé pour :
• Études d’expression génétique
• Analyse d’épissage alternatif
• Détection et découverte d’ARN non codant
• Identification de sites de polyadénylation alternatifs
• Détection de fusion génétique
• Détection d’isoformes de transcription

* Le kit est composé de modules contenant des adaptateurs indexés, de modification enzymatique, de purification / sélection de tailles. Un module supplémentaire de déplétion en ribo de l’ARNr humain / souris / rat peut également être inclus.